该矿属于陆相湖泊沉积硅藻土矿类型中的火山物源矿床亚类，主要分布于浦桥、福泉山、崇仁、逵溪、广利、大湾、四亩岭等地，出露面积35km2，目前仅东南郊浦桥至福泉山约5km2范围进行了较详细的地质工作。
矿层赋存于玄武岩喷溢间歇期形成的河湖相沉积层中。下伏地层为下白垩统期朝川组与部分上侏罗统黄尖组，在它的剥蚀面上沉积了第三系上新统嵊县组地层，上覆第四系残坡积层。地层自上而下为：
第四系，砂砾、砂质粘土 角度不整合0～30m
第三系，上新统嵊县组：
6.第三期橄榄玄武岩。 ＞30m
5.第三沉积层玄武质砂砾岩，下部为含砾粉砂岩。 12～50m
4.第二期玄武岩上层，气孔状橄榄玄武岩，中部见0～0.7m白色含硅藻土薄层或透镜体，下部为致密块状玄武岩。 26～60m
3.第二沉积层上层，上部10～20m，中—细粒砂层、粘土质砂层；中部26～65m白、蓝及少量黑色硅藻土层；底部0～15m含植物碎屑粘土或砂砾层。20～78m
2.第二期玄武岩下层，致密块状橄榄玄武岩。 5～88m
1.第二沉积层下层，顶部为灰白色粘土质砂岩，中部为白、蓝色硅藻土层，下部为砂砾层。5～35m
不整合
白垩系下统朝川组紫红色粉砂岩。
硅藻土产于嵊县组第二沉积层中，含矿二层。出露地表部分风化为白色或灰白色，其余为蓝灰色。上矿层厚26～65m，出露面积40km2。下矿层厚度不到30m，出露面积约30km2。矿体产状近于水平，呈层状、似层状，见下图。
矿层赋存于玄武岩喷溢间歇期形成的河湖相沉积层中。下伏地层为下白垩统期朝川组与部分上侏罗统黄尖组，在它的剥蚀面上沉积了第三系上新统嵊县组地层，上覆第四系残坡积层。地层自上而下为：
第四系，砂砾、砂质粘土 角度不整合0～30m
第三系，上新统嵊县组：
6.第三期橄榄玄武岩。 ＞30m
5.第三沉积层玄武质砂砾岩，下部为含砾粉砂岩。 12～50m
4.第二期玄武岩上层，气孔状橄榄玄武岩，中部见0～0.7m白色含硅藻土薄层或透镜体，下部为致密块状玄武岩。 26～60m
3.第二沉积层上层，上部10～20m，中—细粒砂层、粘土质砂层；中部26～65m白、蓝及少量黑色硅藻土层；底部0～15m含植物碎屑粘土或砂砾层。20～78m
2.第二期玄武岩下层，致密块状橄榄玄武岩。 5～88m
1.第二沉积层下层，顶部为灰白色粘土质砂岩，中部为白、蓝色硅藻土层，下部为砂砾层。5～35m
不整合
白垩系下统朝川组紫红色粉砂岩。
硅藻土产于嵊县组第二沉积层中，含矿二层。出露地表部分风化为白色或灰白色，其余为蓝灰色。上矿层厚26～65m，出露面积40km2。下矿层厚度不到30m，出露面积约30km2。矿体产状近于水平，呈层状、似层状，见下图。
硅藻土含硅藻遗骸60%～80%，此外为粘土矿物及少量粉砂。蓝色硅藻土(称为蓝土)粘土矿物相对含量依次为：高岭石、埃洛石、水云母、蒙脱石；白色硅藻土(称为白土)则依次为蒙脱石、高岭石、埃洛石、水云母。
上、下两层硅藻土的主要化学成分基本相同，不同颜色硅藻土间也无明显变化，只是白土因混入粉砂、粘土，使其SiO2含量相对较低，Al2O3、Fe2O3含量相对较高。矿层中部化学成分比较均匀，平均SiO2 63.94%、Al2O3 16.16%、Fe2O3 4.07%、TiO2 0.8%～1.01%、CaO 0.39%～1.22%、MgO 0.14%～1.38%。
硅藻种属以直链属的冰岛直链藻占优势，约占95%，此外为湖沼圆筛藻、蛛网藻，见个别舟形藻和瑞士桥穹藻，可能还有短缝藻。均为淡水种群。
硅藻土堆密度：上矿层蓝土0.56 g/cm3，白土为0.70 g/cm3，原土孔体积0.6 cm3/g。比表面积46.5 m2/g。主要孔半径50～800nm。耐火度1 470～1 510℃。导热系数0.297～0.264W/(m•K)。原土脱色力33～144。
嵊县硅藻土矿的特点是矿层分布面积广、厚度大、连续性好、品位均匀、硅藻种属单一。沉积环境稳定，属淡水湖泊相生物化学沉积矿床。
